Investigador/a en genómica Genomics Researcher

RTI International es un instituto independiente de investigación científica dedicado a mejorar la condición humana. Nuestra visión es abordar los problemas más críticos del mundo con soluciones técnicas y basadas en la ciencia, en busca de un futuro mejor. Nuestros clientes confían en nosotros para responder preguntas que requieren un enfoque objetivo y multidisciplinario, que integre conocimientos de las ciencias sociales, estadísticas, de datos y de laboratorio, de la ingeniería y de otras disciplinas técnicas para resolver los problemas más complejos del mundo.

Creemos en el potencial de la ciencia y de las soluciones técnicas, y nos esforzamos cada día por hacer realidad ese potencial en beneficio de las personas, las comunidades y las empresas de Estados Unidos y de todo el mundo. Si busca la oportunidad de marcar una diferencia real, RTI es el lugar para usted.

Acerca del grupo de contratación

El Center of GenOmics and Applied Public Health de RTI International tiene una vacante para un/a analista de genómica con experiencia, enfocado/a en el procesamiento, el control de calidad y el análisis de datos de genómica, metabolómica, proteómica y/o datos generados por redes de investigación colaborativa. En colaboración con investigadores, socios de laboratorio y equipos de proyecto multidisciplinarios, el/la analista analizará e interpretará conjuntos de datos complejos y contribuirá a la investigación sobre la salud y las enfermedades humanas. La persona ideal tendrá una maestría en una disciplina pertinente, sólidas habilidades de programación y análisis, experiencia con datos biomédicos de alta dimensionalidad, una sólida base en genética humana y experiencia en la aplicación de métodos estadísticos y computacionales al análisis de datos ómicos. Este puesto está disponible en Research Triangle Park, Carolina del Norte, o de forma remota.

• Procesar y verificar la calidad de datos de metabolómica, proteómica y/o datos generados mediante diversas plataformas por proveedores comerciales o laboratorios universitarios, incluidas las tablas de datos generadas por proveedores o laboratorios y los archivos de instrumentos sin procesar, mediante flujos de trabajo apropiados para cada plataforma para la limpieza y el filtrado de datos, la normalización, la evaluación de datos faltantes y la evaluación de efectos de lote.
• Implementar y solucionar problemas de flujos de trabajo apropiados para cada plataforma a fin de convertir datos instrumentales sin procesar en datos cuantificados de metabolitos o proteínas, incluida la detección de características, la identificación o anotación y la cuantificación, según corresponda al ensayo y en consulta con los socios de laboratorio.
• Desarrollar, mantener y documentar flujos de trabajo reproducibles de procesamiento y análisis; generar conjuntos de datos listos para el análisis, resúmenes de control de calidad y diccionarios de datos.
• Coordinar con los socios de laboratorio y de gestión de datos la recepción y validación de entregas de datos, la conciliación de identificadores de muestras y metadatos, la armonización de conjuntos de datos entre lotes o estudios y la resolución de problemas de calidad de datos.
• Realizar análisis exploratorios y estadísticos bajo la orientación de los investigadores del proyecto, y apoyar la integración de datos de metabolómica y proteómica con otros datos ómicos, clínicos, fenotípicos y ambientales.
• Apoyar y/o dirigir, según sea necesario, los análisis genómicos más amplios del centro, incluido el control de calidad y la imputación de datos de genotipado, los estudios de asociación del genoma completo y la integración de datos genéticos con datos metabolómicos y proteómicos (por ejemplo, el mapeo de loci de rasgos cuantitativos de proteínas o metabolitos).
• Preparar tablas, figuras, descripciones de métodos e informes técnicos; contribuir a manuscritos y/o dirigir su elaboración, y comunicar las decisiones de procesamiento y los resultados analíticos a equipos multidisciplinarios.
• Apoyar el desarrollo de propuestas mediante la dirección o el aporte a secciones técnicas, como los flujos de trabajo de procesamiento de datos, los enfoques analíticos y las necesidades de recursos asociadas.

Requisitos:

• Maestría en Bioinformática, Biología Computacional, Bioquímica, Genética, Estadística o una disciplina relacionada, con 6 años de experiencia laboral pertinente.
• Experiencia en la gestión de grandes conjuntos de datos biomédicos, la validación de metadatos de muestras y características, y el análisis de datos de alta dimensionalidad.
• Experiencia práctica en el procesamiento de datos metabolómicos, proteómicos y/o ómicos, incluidos datos instrumentales sin procesar, y sólido conocimiento del control de calidad específico de cada plataforma, el preprocesamiento y la generación de conjuntos de datos listos para el análisis.
• Conocimientos prácticos de herramientas bioinformáticas y métodos estadísticos para el procesamiento, análisis, visualización e interpretación biológica de datos ómicos.
• Conocimientos fundamentales de genética y genómica humanas, incluidas la variación genética, las versiones de referencia del genoma y la anotación, el desequilibrio de ligamiento, la estructura poblacional y la ascendencia genética, así como los formatos comunes de datos genómicos (por ejemplo, VCF, PLINK, FASTQ/BAM).
• Dominio de R y/o Python, incluida la capacidad de escribir código claro, reutilizable y bien documentado.
• Experiencia laboral en un entorno Unix/Linux.
• Sólidas habilidades de comunicación oral y escrita.
• Capacidad para colaborar de manera respetuosa y eficaz con colegas de distintas disciplinas y equipos de investigación.
• Capacidad para gestionar varias tareas simultáneamente.
• Para cumplir los requisitos, los candidatos deben estar legalmente autorizados a trabajar en Estados Unidos y no deben necesitar patrocinio para obtener una visa de empleo, ni ahora ni en el futuro (por ejemplo, una visa H-1B, etc.).

Requisitos preferidos

• Dominio del trabajo en entornos de computación de alto rendimiento y/o computación en la nube, en particular AWS o Microsoft Azure.
• Experiencia con plataformas comerciales de proteómica, como Olink, incluida la interpretación de métricas de control de calidad proporcionadas por proveedores y el procesamiento de los datos entregados; y familiaridad con flujos de trabajo de metabolómica o proteómica basados en espectrometría de masas y procesos de laboratorio previos al análisis. La experiencia de laboratorio húmedo es útil, pero no obligatoria.
• Experiencia en metabolómica y proteómica, armonización entre estudios, integración multi-ómica o análisis de vías y enriquecimiento.
• Experiencia en análisis genéticos, como control de calidad e imputación de genotipos, GWAS, mapeo de QTL (por ejemplo, pQTL o mQTL), procesamiento de matrices de metilación de ADN o análisis de RNA-seq, utilizando herramientas como PLINK, SAIGE o paquetes de Bioconductor.
• Experiencia en el uso de sistemas de control de versiones, como Git, y herramientas de gestión de flujos de trabajo para respaldar análisis reproducibles.
• Experiencia con datos de investigación en los que participan seres humanos.

Declaraciones sobre igualdad de oportunidades de empleo (EEO) e igualdad salarial

Solo para anuncios de empleo en San Francisco, CA, EE. UU.: De conformidad con la Ordenanza Fair Chance de San Francisco, consideraremos para el empleo a solicitantes calificados con antecedentes de arrestos y condenas. Hay más información disponible aquí.

RTI acepta solicitudes para sus vacantes de candidatos con antecedentes penales o condenas, de conformidad con todas las leyes aplicables, incluida la Ordenanza Fair Chance para empleadores del condado de Los Ángeles y la Ley Fair Chance de California.

Solo para solicitantes en Massachusetts: En Massachusetts es ilegal exigir o administrar una prueba de detector de mentiras como condición para obtener o conservar un empleo. Todo empleador que infrinja esta ley estará sujeto a sanciones penales y responsabilidad civil.

El rango salarial previsto para este puesto se indica a continuación. Nuestros rangos salariales representan promedios nacionales y pueden variar según la ubicación, ya que puede aplicarse un diferencial geográfico en algunas ubicaciones dentro de Estados Unidos. Al hacer una oferta, RTI considera varios factores, por ejemplo: el rango salarial establecido, el presupuesto interno, las necesidades del negocio, y la formación y los años de experiencia laboral de la persona solicitante. Además, el salario es solo uno de los componentes de nuestra oferta.

En RTI, demostramos nuestro compromiso con la recompensa del desempeño individual y de equipo mediante un paquete integral de recompensas. Este paquete incluye, entre otras cosas, un salario base competitivo, una generosa política de tiempo libre remunerado, aumentos anuales basados en el mérito, oportunidades de bonificaciones y un sólido programa de reconocimiento. Otros beneficios incluyen una variedad competitiva de planes de seguro (incluidos seguro médico, dental y de vida, así como cobertura por discapacidad a corto y largo plazo), acceso a un programa de ahorro para la jubilación, como un plan 401(k), licencia parental remunerada para todos los padres, asistencia financiera para gastos de adopción o tratamientos de infertilidad, reembolso de gastos de educación y oportunidades de desarrollo, un programa de asistencia para empleados y muchas otras opciones para apoyar un equilibrio saludable entre el trabajo y la vida personal.

Publicado originalmente en Himalayas