Científico sénior de bioinformática
Senior Bioinformatics Scientist
- Remoto (EE. UU.)
- $150,000 – $189,000 por año
- Tiempo completo
- Publicado hace 1 día
Se postulará en el sitio web original.
Sobre este empleo
En Veracyte, ofrecemos interesantes oportunidades profesionales a quienes desean unirse a un equipo pionero comprometido con transformar la atención del cáncer para pacientes de todo el mundo. Trabajar en Veracyte permite a nuestros empleados no solo tener un impacto significativo en la vida de los pacientes, sino también aprender y crecer en un entorno guiado por un propósito. A esto lo llamamos la manera Veracyte: se trata de cómo trabajamos en equipo, guiados por nuestros valores, para ofrecer a los profesionales clínicos la información que necesitan para ayudar a los pacientes a tomar decisiones que pueden cambiar sus vidas.
Nuestros valores:
- Buscamos una mejor manera: Perseguimos ideas audaces, aceptamos la complejidad y seguimos avanzando.
- Hacemos que suceda: Actuamos con urgencia, cumplimos con excelencia y siempre encontramos la manera.
- Somos más fuertes en equipo: Nos relacionamos con empatía, nos alineamos en torno a lo que es mejor para Veracyte y celebramos como un solo equipo.
- Nos importa profundamente: Actuamos con integridad, amabilidad y respeto mutuo.
El puesto:
Buscamos un/a científico/a sénior de bioinformática con amplia experiencia y motivación para impulsar el diseño y desarrollo de pruebas de laboratorio desarrolladas internamente (LDT) de nueva generación para la enfermedad residual mínima (MRD). Este puesto sénior, de trabajo independiente, es responsable de contribuir a los conceptos de los ensayos, impulsar el desarrollo y la validación analíticos, y colaborar estrechamente con los equipos de laboratorio experimental, clínica, calidad, asuntos regulatorios y software para ofrecer pruebas diagnósticas de MRD sólidas y clínicamente útiles para varias indicaciones.
La persona ideal cuenta con experiencia en ensayos oncológicos basados en NGS, un sólido conocimiento de la biología del ctDNA y una trayectoria comprobada en el desarrollo de ensayos en la industria bajo controles de diseño. Esta persona liderará la ejecución técnica de iniciativas científicas clave y será responsable de la bioinformática de los ensayos desde el concepto hasta la validación analítica y el lanzamiento.
RESPONSABILIDADES PRINCIPALES:
Experiencia científica y técnica
- Contribuir a la estrategia de bioinformática para el diseño, desarrollo, optimización y gestión del ciclo de vida de ensayos de MRD para LDT desarrolladas bajo sistemas de calidad CAP/CLIA.
- Liderar y contribuir al diseño de estudios, análisis de datos, caracterización del desempeño y toma de decisiones durante todo el desarrollo.
- Aplicar conocimientos especializados en genómica del cáncer, biología del ctDNA y tecnologías NGS para orientar la arquitectura de los ensayos, las estrategias de detección de variantes y los métodos de supresión de errores, en colaboración con los equipos de ciencia de datos y modelado.
Desarrollo y validación de ensayos
- Diseñar y ejecutar estudios analíticos para evaluar el desempeño de los ensayos, incluidos la exactitud, el límite de detección y la reproducibilidad, en colaboración con los equipos de laboratorio experimental y bioestadística.
- Desarrollar, validar y mantener flujos de trabajo bioinformáticos escalables y listos para producción para el análisis de MRD, incluidos el control de calidad (QC), la identificación de variantes, la lógica para determinar MRD y la generación de informes.
- Liderar la evaluación comparativa y optimización de métodos computacionales, incluidos el modelado de errores de fondo y el seguimiento longitudinal de MRD.
- Asegurar el cumplimiento de las normas (CAP/CLIA, FDA, IVDR) durante todo el ciclo de desarrollo bioinformático, incluidas pruebas y documentación rigurosas.
Colaboración interfuncional
- Colaborar estrechamente con los equipos de biología molecular, desarrollo de ensayos, aseguramiento de calidad/asuntos regulatorios (QA/RA), clínica e ingeniería de software para garantizar que las soluciones bioinformáticas se ajusten al diseño de los ensayos, las expectativas regulatorias y las limitaciones operativas.
- Contribuir a presentaciones regulatorias y auditorías mediante la preparación de documentación técnica e informes de validación, y la elaboración de respuestas a auditorías o consultas regulatorias.
Mentoría e influencia
- Ofrecer mentoría técnica y orientación científica a científicos júnior, ayudando a elevar el nivel general de rigor y ejecución en el desarrollo de ensayos.
- Comunicar claramente conceptos y resultados analíticos complejos a partes interesadas tanto computacionales como no computacionales, incluido el equipo directivo sénior.
Quién eres:
EXPERIENCIA REQUERIDA:
- Doctorado en Bioinformática, Biología Computacional, Genómica, Bioestadística o un campo cuantitativo estrechamente relacionado. (o maestría más 3 años adicionales de experiencia en la industria).
- Un mínimo de 6 años de experiencia relevante total en biotecnología, diagnóstico o entornos de atención médica regulados.
- Experiencia demostrada en el desarrollo de ensayos basados en NGS para diagnóstico clínico. Experiencia práctica con ensayos de MRD basados en ctDNA, incluidos enfoques personalizados o basados en el tumor.
- Sólidas habilidades de programación en Python y experiencia en el desarrollo de flujos de trabajo de análisis reproducibles y de calidad de producción, incluida experiencia con las mejores prácticas del SDLC.
- Experiencia comprobada en entornos regulados con controles de diseño (LDT bajo CAP/CLIA, IVD o equivalente).
- Dominio del desarrollo de metodologías bioinformáticas novedosas y del desarrollo de algoritmos, incluida la evaluación comparativa de métodos computacionales.
- Trayectoria de colaboración con científicos de laboratorio experimental en el diseño iterativo de experimentos, su ejecución, análisis e interpretación, como parte de un equipo estrechamente integrado.
- Historial demostrado de responsabilidad técnica y científica, y capacidad para trabajar de manera independiente.
EXPERIENCIA PREFERIDA:
- Experiencia en el desarrollo y la implementación de flujos de trabajo bioinformáticos en AWS (p. ej., EC2, S3, Step Functions, Batch, Lambda, etc.).
- Sólido conocimiento de los procesos de mutación de la línea germinal y somática que dan lugar a variaciones complejas y biomarcadores genómicos a escala del genoma con posible utilidad clínica.
- Conocimientos prácticos de R.
- Se valorará la experiencia con tecnologías de bases de datos relacionales y no relacionales.
#LI-Onsite, #LI-Hybrid, or #LI-Remote
Para candidatos que trabajen desde nuestra oficina de San Diego, el rango salarial es de $160,000 - $180,000.
Para candidatos que trabajen desde nuestra oficina de South San Francisco, el rango salarial es de $175,000 - $189,000.
Para candidatos que trabajen a distancia (EE. UU.), el rango salarial es de $150,000 - $168,000.
El salario final que se ofrezca a la persona seleccionada dependerá de varios factores, que pueden incluir, entre otros, los años de experiencia, el conjunto de habilidades, la ubicación geográfica, la industria y la educación. El salario base es una parte del paquete total que se ofrece para compensar y reconocer el trabajo de los empleados; este puesto también podría ser elegible para bonificaciones/incentivos discrecionales adicionales y unidades de acciones restringidas.
Rango salarial
$150,000—$189,000 USD
Lo que podemos ofrecerte
Veracyte es una empresa en crecimiento que ofrece importantes oportunidades profesionales a personas curiosas, motivadas y orientadas a los pacientes, que aspiran a ayudarnos a construir una gran empresa. Ofrecemos remuneración y beneficios competitivos, y nos comprometemos a fomentar una fuerza laboral inclusiva, donde haya representación de diversos orígenes y las personas se sientan involucradas y empoderadas para impulsar ideas y decisiones innovadoras. Nos enorgullece haber sido reconocidos como Certified™ Great Place to Work® de 2024 tanto en EE. UU. como en Israel, un testimonio de nuestro entorno laboral dinámico, inclusivo e inspirador, donde la pasión se une con el propósito.
Acerca de Veracyte
Veracyte (Nasdaq: VCYT) es una empresa global de diagnóstico cuya visión es transformar la atención del cáncer para pacientes de todo el mundo. Empoderamos a los profesionales clínicos con la información de alto valor que necesitan para orientar y dar seguridad a los pacientes en momentos decisivos de la carrera por diagnosticar y tratar el cáncer. Nuestra plataforma de diagnóstico Veracyte ofrece pruebas de cáncer de alto desempeño, respaldadas por amplios datos genómicos y clínicos, sólidas capacidades de bioinformática e IA, y un potente motor de generación de evidencia. Esto, en última instancia, impulsa el reembolso sostenido y la inclusión de nuestras pruebas en las guías clínicas, además de generar nuevos conocimientos que respaldan la innovación continua y el desarrollo de nuestra cartera de productos. Para obtener más información, visite www.veracyte.com o síganos en LinkedIn o X (Twitter).
Veracyte, Inc. es una empresa que ofrece igualdad de oportunidades de empleo y considerará a todos los solicitantes calificados para el empleo sin distinción de raza, color, religión, sexo, orientación sexual, identidad de género, origen nacional, condición de veterano protegido o discapacidad. Veracyte participa en E-Verify en Estados Unidos. Consulte nuestro Aviso de divulgación de la CCPA.
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Anuncio original en inglés
At Veracyte, we offer exciting career opportunities for those interested in joining a pioneering team that is committed to transforming cancer care for patients across the globe. Working at Veracyte enables our employees to not only make a meaningful impact on the lives of patients, but to also learn and grow within a purpose driven environment. This is what we call the Veracyte way – it’s about how we work together, guided by our values, to give clinicians the insights they need to help patients make life-changing decisions.
Our Values:
- We Seek A Better Way: We pursue bold ideas, embrace complexity, and keep pushing forward.
- We Make It Happen: We act with urgency, deliver with excellence, and always find a way.
- We Are Stronger Together: We engage with empathy, align around what's best for Veracyte, and celebrate as one team.
- We Care Deeply: We show up with integrity, kindness, and respect for one another.
The Position:
We are seeking a highly experienced and motivated Senior Bioinformatics Scientist to drive the design, and development of next‑generation minimal residual disease (MRD) laboratory‑developed tests (LDTs). This senior, independent scientist position is responsible for contributing to assay concepts, driving analytical development and validation, and partnering closely with wet‑lab, clinical, quality, regulatory, and software teams to deliver robust, clinically actionable MRD diagnostics for multiple indications.
The ideal candidate brings expertise in NGS‑based oncology assays, strong understanding of ctDNA biology and a proven track record of industry assay development under design control. This individual will lead technical execution of key scientific efforts, owning assay bioinformatics from concept through analytical validation and launch.
KEY RESPONSIBILITIES:
Scientific & Technical Expertise
- Contribute to bioinformatics strategy for MRD assay design, development, optimization, and lifecycle management for LDTs developed under CAP/CLIA quality systems.
- Lead and contribute to study design, data analysis, performance characterization, and decision‑making throughout development.
- Apply deep domain knowledge in cancer genomics, ctDNA biology, and NGS technologies to inform assay architecture, variant detection strategies, and error suppression approaches in collaboration with our data science and modeling teams.
Assay Development & Validation
- Design and execute analytical studies to evaluate assay performance, including accuracy, limit of detection, and reproducibility, in collaboration with wet‑lab and biostatistics partners.
- Develop, validate, and maintain scalable, production‑ready bioinformatics pipelines for MRD analysis, including QC, variant calling, MRD calling logic, and reporting.
- Lead benchmarking and optimization of computational methods, including background error modeling, and longitudinal MRD tracking.
- Ensure compliance with standards (CAP/CLIA, FDA, IVDR) throughout the bioinformatics development lifecycle, including rigorous testing and documentation.
Cross‑Functional Collaboration
- Partner closely with molecular biology, assay development, QA/RA, clinical, and software engineering teams to ensure bioinformatics solutions are aligned with assay design, regulatory expectations, and operational constraints.
- Contribute to regulatory submissions and audits by providing technical documentation and validation report, and responses to audits or regulatory inquiries.
Mentorship & Influence
- Provide technical mentorship and scientific guidance to junior scientists, helping raise the overall bar of assay development rigor and execution.
- Communicate complex analytical concepts and results clearly to both computational and non‑computational stakeholders, including senior leadership.
Who You Are:
REQUIRED EXPERIENCE:
- Ph.D. in Bioinformatics, Computational Biology, Genomics, Biostatistics, or a closely related quantitative field. (or M.Sc. plus 3 additional years industry experience).
- Minimum 6 years of total relevant experience in biotech, diagnostics, or regulated healthcare environments.
- Demonstrated experience in NGS‑based assay development for clinical diagnostics. Hands‑on experience with ctDNA‑based MRD assays, including personalized or tumor‑informed approaches.
- Strong programming skills in Python, with experience developing reproducible, production‑grade analysis pipelines, including experience with SDLC best practices.
- Proven experience working in design‑controlled, regulated environments (CAP/CLIA LDT, IVD, or equivalent).
- Proficiency in development of novel bioinformatics methodologies, and algorithms development, including benchmarking of computational methods.
- Track record of working with wet lab scientists on iterative experiment design, execution, analysis, and interpretation as a tightly integrated team.
- Demonstrated record of technical and scientific ownership, and independent work.
PREFERRED EXPERIENCE:
- Experience developing and deploying bioinformatics workflows in AWS (e.g., EC2, S3, Step Functions, Batch, Lambda, etc.).
- Strong understanding of germline and somatic mutation processes leading to complex variation and genome-wide biomarkers with potential clinical utility.
- Working knowledge of R.
- Experience with relational and non-relational database technologies is a plus.
#LI-Onsite, #LI-Hybrid, or #LI-Remote
For candidates based in our San Diego office, the salary range is $160,000 - $180,000.
For candidates based in our South San Francisco office, the salary range is $175,000 - $189,000.
For candidates working remote (US), the salary range is $150,000 - $168,000.
The final salary offered to a successful candidate will be dependent on several factors that may include but are not limited to years of experience, skillset, geographic location, industry, education, etc. Base pay is one part of the Total Package that is provided to compensate and recognize employees for their work, and this role may be eligible for additional discretionary bonuses/incentives, and restricted stock units.
Pay range
$150,000—$189,000 USD
What We Can Offer You
Veracyte is a growing company that offers significant career opportunities if you are curious, driven, patient-oriented and aspire to help us build a great company. We offer competitive compensation and benefits, and are committed to fostering an inclusive workforce, where diverse backgrounds are represented, engaged, and empowered to drive innovative ideas and decisions. We are thrilled to be recognized as a 2024 Certified™ Great Place to Work® in both the US and Israel - a testament to our dynamic, inclusive, and inspiring workplace where passion meets purpose.
About Veracyte
Veracyte (Nasdaq: VCYT) is a global diagnostics company whose vision is to transform cancer care for patients all over the world. We empower clinicians with the high-value insights they need to guide and assure patients at pivotal moments in the race to diagnose and treat cancer. Our Veracyte Diagnostics Platform delivers high-performing cancer tests that are fueled by broad genomic and clinical data, deep bioinformatic and AI capabilities, and a powerful evidence-generation engine, which ultimately drives durable reimbursement and guideline inclusion for our tests, along with new insights to support continued innovation and pipeline development. For more information, please visit www.veracyte.com or follow us on LinkedIn or X (Twitter).
Veracyte, Inc. is an Equal Opportunity Employer and will consider all qualified applicants for employment without regard to race, color, religion, sex, sexual orientation, gender identity, national origin, protected veteran status or disability status. Veracyte participates in E-Verify in the United States. View our CCPA Disclosure Notice
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