Científico/a sénior de bioinformática
Sr. Bioinformatics Scientist
- Remoto (EE. UU.)
- $150,000 – $189,000 por año
- Tiempo completo
- Publicado hace 1 día
Se postulará en el sitio web original.
Sobre este empleo
En Veracyte, ofrecemos emocionantes oportunidades profesionales a quienes desean unirse a un equipo pionero comprometido con transformar la atención del cáncer para pacientes de todo el mundo. Trabajar en Veracyte permite a nuestros empleados no solo tener un impacto significativo en la vida de los pacientes, sino también aprender y crecer en un entorno guiado por un propósito. A esto lo llamamos la manera Veracyte: se trata de cómo trabajamos juntos, guiados por nuestros valores, para brindar a los médicos la información que necesitan para ayudar a los pacientes a tomar decisiones que pueden cambiarles la vida.
Nuestros valores:
- Buscamos una mejor manera: impulsamos ideas audaces, aceptamos la complejidad y seguimos avanzando.
- Hacemos que las cosas sucedan: actuamos con urgencia, cumplimos con excelencia y siempre encontramos la manera.
- Juntos somos más fuertes: actuamos con empatía, nos alineamos en torno a lo que es mejor para Veracyte y celebramos como un solo equipo.
- Nos importa profundamente: nos comportamos con integridad, amabilidad y respeto mutuo.
El puesto:
Buscamos un/a científico/a de bioinformática con experiencia y motivación para incorporarse a nuestro equipo de Bioinformática y Ciencia de Datos, enfocado en el desarrollo de productos de diagnóstico regulados. La persona ideal aportará sólidos conocimientos especializados en tecnologías NGS y una comprensión profunda de los entornos regulatorios, incluidos CAP/CLIA y el desarrollo de productos IVD. La persona seleccionada desempeñará un papel crucial en el diseño, desarrollo y optimización de nuestra próxima generación de ensayos genómicos. Este puesto requiere una combinación singular de experiencia en bioinformática, amplia experiencia en optimización de ensayos y validación analítica, sólidas habilidades para desarrollar, automatizar y optimizar flujos de análisis, un conocimiento profundo de biología molecular y pasión por convertir datos biológicos complejos en información útil para la toma de decisiones.
- RESPONSABILIDADES PRINCIPALES:
- Liderar las actividades de diseño, desarrollo y validación bioinformáticos para el desarrollo de ensayos de productos nuevos y comercializados. Como integrante de los equipos centrales de proyecto, esta persona será responsable de coordinar la planificación, ejecución y entrega dentro de los plazos y límites presupuestarios.
- Desarrollar flujos de trabajo escalables y listos para producción para el análisis de datos NGS de alto rendimiento mediante AWS y entornos con contenedores.
- Facilitar la implementación exitosa de flujos de análisis de producción mediante una estrecha colaboración con los equipos de infraestructura e ingeniería.
- Garantizar el cumplimiento de las normas regulatorias (CAP/CLIA, FDA, IVDR) durante todo el ciclo de desarrollo bioinformático, incluidas pruebas y documentación rigurosas. Aplicar conocimientos de vanguardia en bioinformática, genómica y tecnologías de ensayos para contribuir al desarrollo de los conceptos y principios de la empresa y alcanzar los objetivos de desarrollo de ensayos de maneras creativas y eficaces.
- Aplicar conocimientos de vanguardia en bioinformática, genómica y tecnologías de ensayos para contribuir al desarrollo de los conceptos y principios de la empresa y alcanzar los objetivos de desarrollo de ensayos de maneras creativas y eficaces.
- Impulsar el diseño de estudios de desarrollo y todos los análisis para las actividades de desarrollo de ensayos, en colaboración con equipos multidisciplinarios.
- Desarrollar técnicas estadísticas y de aprendizaje automático para evaluar exhaustivamente el rendimiento de los ensayos y crear estrategias de optimización.
- Comunicar los resultados de análisis, las metodologías y los hallazgos científicos a equipos internos, colaboradores externos y partes interesadas.
- Contribuir a las presentaciones regulatorias y auditorías mediante documentación técnica e informes de validación.
- Brindar orientación científica y mentoría a los miembros júnior del equipo de bioinformática.
Quién es usted:
EXPERIENCIA REQUERIDA:
- Doctorado o maestría en bioinformática, biología computacional o un campo afín de ciencia de datos, como bioestadística, estadística o informática.
- Experiencia comprobada: mínimo de 6 -7 años de experiencia en análisis bioinformático, desarrollo de algoritmos e implementación de flujos de trabajo.
- Comprensión exhaustiva de las tecnologías NGS y diversos métodos de preparación de bibliotecas (WGS, enriquecimiento, RNA-Seq, metilación, etc.).
- Dominio de la transcriptómica cuantitativa a partir de datos NGS o de microarrays de expresión en enfermedades/biología humanas, específicamente en áreas como expresión diferencial, reducción de dimensiones, desarrollo de clasificadores basados en expresión, firmas basadas en ARN y deconvolución de tipos celulares.
- Dominio del aprendizaje automático, el desarrollo de nuevas metodologías bioinformáticas y el desarrollo de algoritmos, incluida la evaluación comparativa de métodos computacionales.
- Experiencia comprobada en el desarrollo y la implementación de flujos de trabajo bioinformáticos en AWS (p. ej., EC2, S3, Step Functions, Batch, Lambda, etc.).
- Sólido dominio de Python, incluida experiencia con marcos de pruebas y mejores prácticas del ciclo de vida del desarrollo de software (SDLC).
- Colaboración estrecha con los equipos de Calidad y Asuntos Regulatorios en el desarrollo y la verificación de ensayos y flujos de análisis.
- Historial demostrado de liderazgo técnico y científico, sentido de responsabilidad y capacidad para trabajar de forma independiente.
EXPERIENCIA PERTINENTE (preferida, pero no obligatoria):
- Trayectoria de colaboración con científicos de laboratorio en el diseño iterativo de experimentos, su ejecución, análisis e interpretación como parte de un equipo estrechamente integrado.
- Dominio de genómica, análisis de secuencias y análisis secundario, como la identificación de variantes (p. ej., SNV/MNV/indels, CNV, variantes estructurales), control de calidad de NGS, empalme y ácidos nucleicos circulares.
- Sólida comprensión de los procesos de mutación germinal y somática que conducen a variaciones complejas y biomarcadores genómicos con posible utilidad clínica, como TMB, firmas mutacionales y LOH.
- Conocimientos prácticos de R.
- Se valorará la experiencia con tecnologías de bases de datos relacionales y no relacionales.
- Excelentes habilidades para comunicar temas técnicos complejos en entornos interdisciplinarios, especialmente mediante visualizaciones de datos y diagramas.
- Excelentes habilidades de resolución de problemas técnicos y diagnóstico y solución de problemas.
ADECUACIÓN CULTURAL:
- Pasión por la innovación: Siente una profunda curiosidad y le motiva explorar territorios inexplorados en genómica. Su pasión por el descubrimiento le impulsa a utilizar enfoques analíticos novedosos para aportar nuevas perspectivas a la optimización y evaluación de ensayos.
- Espíritu colaborativo: Se desenvuelve bien en un entorno colaborativo y aporta una actitud positiva y resolutiva a los proyectos interdisciplinarios. Se le da bien comunicar ideas complejas a personas no expertas y escuchar activamente, fomentando un ambiente inclusivo que valora la contribución de cada integrante del equipo. Está abierto/a a recibir comentarios y motivado/a para responder mejor a las necesidades del equipo.
- Adaptabilidad: En nuestro sector dinámico, el cambio es constante. Es una persona ágil y flexible, preparada para ajustar las estrategias ante nuevos datos o tecnologías. Su resiliencia y apertura mental ayudan al equipo a afrontar las incertidumbres inherentes a la investigación innovadora.
#LI-Hybrid, or #LI-Remote
Para candidatos ubicados en nuestra oficina de San Diego, el rango salarial es $160,000 - $180,000.
Para candidatos ubicados en nuestra oficina de South San Francisco, el rango salarial es $175,000 - $189,000.
Para candidatos que trabajen de forma remota (EE. UU.), el rango salarial es $150,000 - $168,000.
El salario final ofrecido a la persona seleccionada dependerá de varios factores, que pueden incluir, entre otros, los años de experiencia, las habilidades, la ubicación geográfica, el sector, la educación, etc. El salario base es una parte del paquete total que se ofrece para remunerar y reconocer el trabajo de los empleados. Este puesto podría ser elegible para bonificaciones/incentivos discrecionales adicionales y unidades de acciones restringidas.
Rango salarial
$150,000—$189,000 USD
Lo que podemos ofrecerle
Veracyte es una empresa en crecimiento que ofrece importantes oportunidades profesionales a personas curiosas, motivadas y centradas en los pacientes, que aspiran a ayudarnos a construir una gran empresa. Ofrecemos compensación y beneficios competitivos, y nos comprometemos a fomentar una fuerza laboral inclusiva, donde haya representación de diversos orígenes y las personas puedan participar y desarrollar su potencial para impulsar ideas y decisiones innovadoras. Nos enorgullece que se nos haya reconocido como Great Place to Work® Certified™ 2024 tanto en EE. UU. como en Israel, un testimonio de nuestro entorno laboral dinámico, inclusivo e inspirador, donde la pasión se une al propósito.
Acerca de Veracyte
Veracyte (Nasdaq: VCYT) es una empresa global de diagnóstico cuya visión es transformar la atención del cáncer para pacientes de todo el mundo. Brindamos a los médicos información de gran valor para orientar y dar seguridad a los pacientes en momentos decisivos de la carrera por diagnosticar y tratar el cáncer. Nuestra plataforma de diagnóstico de Veracyte ofrece pruebas de cáncer de alto rendimiento, respaldadas por amplios datos genómicos y clínicos, sólidas capacidades de bioinformática e inteligencia artificial (IA) y un potente motor de generación de evidencia. En última instancia, esto impulsa el reembolso sostenido y la inclusión de nuestras pruebas en guías clínicas, además de generar nuevos conocimientos para respaldar la innovación continua y el desarrollo de la cartera de productos. Para obtener más información, visite www.veracyte.com o síganos en LinkedIn o X (Twitter).
Veracyte, Inc. es un empleador que ofrece igualdad de oportunidades y considerará a todos los solicitantes calificados para el empleo sin distinción de raza, color, religión, sexo, orientación sexual, identidad de género, origen nacional, condición de veterano protegido o discapacidad. Veracyte participa en E-Verify en Estados Unidos. Consulte nuestro Aviso de divulgación de la CCPA
Si recibe alertas o comunicaciones sospechosas a través de LinkedIn u otros sitios de empleo en línea sobre cualquier puesto en Veracyte, tenga cuidado e informe de inmediato cualquier inquietud a careers@veracyte.com
Anuncio original en inglés
At Veracyte, we offer exciting career opportunities for those interested in joining a pioneering team that is committed to transforming cancer care for patients across the globe. Working at Veracyte enables our employees to not only make a meaningful impact on the lives of patients, but to also learn and grow within a purpose driven environment. This is what we call the Veracyte way – it’s about how we work together, guided by our values, to give clinicians the insights they need to help patients make life-changing decisions.
Our Values:
- We Seek A Better Way: We pursue bold ideas, embrace complexity, and keep pushing forward.
- We Make It Happen: We act with urgency, deliver with excellence, and always find a way.
- We Are Stronger Together: We engage with empathy, align around what's best for Veracyte, and celebrate as one team.
- We Care Deeply: We show up with integrity, kindness, and respect for one another.
The Position:
We are seeking an experienced and motivated Bioinformatics Scientist to join our Bioinformatics and Data Science Team focused on developing regulated diagnostics products. The ideal candidate will bring deep expertise in NGS technologies with a strong understanding of regulatory environments including CAP/CLIA and IVD product development. The successful candidate will play a crucial role in designing, developing, and optimizing our next generation of genomic assays. This position requires a unique blend of expertise in bioinformatics, extensive experience in assay optimization, analytical validation, strong skills in analytical pipeline development, automation and optimization, a deep understanding of molecular biology, and a passion for transforming complex biological data into actionable insights.
- KEY RESPONSIBILITIES:
- Lead bioinformatics design, development and validation efforts in assay development for new and on-market products. As part of project core teams, this individual must be responsible for coordinating planning, execution, and delivery within timelines and budget constraints.
- Develop scalable, production-grade workflows for high-throughput NGS data analysis using AWS and containerized environments.
- Facilitate successful production pipeline deployment by working closely with infrastructure and engineering teams
- Ensure compliance with regulatory standards (CAP/CLIA, FDA, IVDR) throughout the bioinformatics development lifecycle, including rigorous testing and documentation.Apply leading edge knowledge in bioinformatics, genomics, and assay technologies, to contribute to development of company's concepts and principles and to achieve assay development objectives in creative and effective ways.
- Apply leading edge knowledge in bioinformatics, genomics, and assay technologies to contribute to development of the company's concepts and principles and to achieve assay development objectives in creative and effective ways.
- Drive development study design and all analysis for assay development effort in collaboration with cross-functional teams.
- Develop statistical and machine learning techniques to comprehensively evaluate assay performance and create optimization strategies.
- Communicate analysis results, methodologies, and scientific findings to internal teams, external collaborators, and stakeholders.
- Contribute to regulatory submissions and audits by providing technical documentation and validation reports.
- Provide scientific guidance and mentorship to junior bioinformatics team members.
Who You Are:
REQUIRED EXPERIENCE:
- PhD or MS in bioinformatics, computational biology, or an adjacent data science field, such as biostatistics, statistics or computer science.
- Proven experience - A minimum of 6 -7 years of experience in bioinformatics analysis, algorithm development, and pipeline implementation.
- Thorough understanding of NGS technologies and various methods for library preparation (WGS, enrichment, RNA-Seq, methylation, etc.).
- Proficiency in quantitative transcriptomics from NGS or expression microarray data in human disease/biology specifically, such as differential expression, dimension reduction, expression-based classifier development, RNA-based signatures, cell type deconvolution.
- Proficiency in machine learning, development of novel bioinformatics methodologies, and algorithms development, including benchmarking of computational methods.
- Proven experience developing and deploying bioinformatics workflows in AWS (e.g., EC2, S3, Step Functions, Batch, Lambda, etc.).
- Strong proficiency in Python, including experience with testing frameworks and SDLC best practices.
- Close collaboration with Quality and Regulatory Affairs team on assay and analysis pipeline development and verification.
- Demonstrated record of technical and scientific leadership, ownership, and independent work.
RELEVANT EXPERIENCE (preferred but not required):
- Track record of working with wet lab scientists on iterative experiment design, execution, analysis, and interpretation as a tightly integrated team.
- Proficiency in genomics, sequence analysis, and secondary analysis, such as variant calling (e.g., SNVs/MNVs/indels, CNV, structural variants), NGS QC, splicing, circular nucleic acids.
- Strong understanding of germline and somatic mutation processes leading to complex variation and genome-wide biomarkers with potential clinical utility, such as TMB, mutational signatures, LOH.
- Working knowledge of R.
- Experience with relational and non-relational database technologies is a plus.
- Excellent communicator about complex technical topics in an interdisciplinary setting, especially by using data visualizations and diagrams.
- Excellent technical problem solving and troubleshooting skills.
CULTURAL FIT:
- Passion for Innovation: You are deeply curious and driven to explore uncharted territories in genomics. Your passion for discovery motivates you to use novel analytical approaches to bring new insights to assay optimization and evaluation.
- Collaborative Spirit: You thrive in a collaborative environment, bringing a positive, can-do attitude to interdisciplinary projects. You are skilled at communicating complex ideas to non-experts and active listening, fostering an inclusive atmosphere that values each team member's contribution. You are receptive to feedback and motivated to better serve the team’s needs.
- Adaptability: In our fast-paced industry, change is constant. You are agile and flexible, ready to pivot strategies in response to new data or technologies. Your resilience and open-mindedness help our team navigate the uncertainties inherent in groundbreaking research.
#LI-Hybrid, or #LI-Remote
For candidates based in our San Diego office, the salary range is $160,000 - $180,000.
For candidates based in our South San Francisco office, the salary range is $175,000 - $189,000.
For candidates working remote (US), the salary range is $150,000 - $168,000.
The final salary offered to a successful candidate will be dependent on several factors that may include but are not limited to years of experience, skillset, geographic location, industry, education, etc. Base pay is one part of the Total Package that is provided to compensate and recognize employees for their work, and this role may be eligible for additional discretionary bonuses/incentives, and restricted stock units.
Pay range
$150,000—$189,000 USD
What We Can Offer You
Veracyte is a growing company that offers significant career opportunities if you are curious, driven, patient-oriented and aspire to help us build a great company. We offer competitive compensation and benefits, and are committed to fostering an inclusive workforce, where diverse backgrounds are represented, engaged, and empowered to drive innovative ideas and decisions. We are thrilled to be recognized as a 2024 Certified™ Great Place to Work® in both the US and Israel - a testament to our dynamic, inclusive, and inspiring workplace where passion meets purpose.
About Veracyte
Veracyte (Nasdaq: VCYT) is a global diagnostics company whose vision is to transform cancer care for patients all over the world. We empower clinicians with the high-value insights they need to guide and assure patients at pivotal moments in the race to diagnose and treat cancer. Our Veracyte Diagnostics Platform delivers high-performing cancer tests that are fueled by broad genomic and clinical data, deep bioinformatic and AI capabilities, and a powerful evidence-generation engine, which ultimately drives durable reimbursement and guideline inclusion for our tests, along with new insights to support continued innovation and pipeline development. For more information, please visit www.veracyte.com or follow us on LinkedIn or X (Twitter).
Veracyte, Inc. is an Equal Opportunity Employer and will consider all qualified applicants for employment without regard to race, color, religion, sex, sexual orientation, gender identity, national origin, protected veteran status or disability status. Veracyte participates in E-Verify in the United States. View our CCPA Disclosure Notice
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